Objectifs
03/07/12 14:04

Le « pourquoi » du projet

Ce projet, dans lequel sont impliqués six centres de recherche, a deux objectifs fondamentaux : séquencer pour la première fois le génome d'un lynx et générer un vaste ensemble de marqueurs pour l'analyse de l'espèce. En réalité il s'agit de construire deux outils qui offriront le premier instantané complet de la variation génomique contemporaine et mondiale du lynx ibérique. Une information qu'il faudra analyser pour connaître les effets qui se produisent au niveau génétique quand une espèce est en danger d'extinction.

Les objectifs spécifiques sont :

  • Produire un brouillon du génome du lynx ibérique de haute qualité, de telle manière qu'il soit la base des futures recherches.
  • Séquencer et interpréter le transcriptome du lynx ibérique.
  • Comparer les analyses génomiques des lynx ibérique et européen et celles du chat pour vérifier les similitudes et différences.
  • Générer une bibliothèque BAC comme une source pour de futures études et comme validations futures du brouillon du génome.
  • Interpréter les principales variations du génome obtenues à travers des techniques de séquençage aléatoires de 10 autres individus.
  • Générer un vaste ensemble de marqueurs pour l'étude des populations.
  • Interpréter les variations existantes en se basant sur les marqueurs sélectionnés et un vaste échantillon des populations existantes.

 

Pour atteindre cet objectif, le projet devra avoir recours à la synergie des éléments suivants :

  • Les connaissances récentes dans les techniques de séquençage du génome, qui donnent lieu à de meilleurs rendements et de moindres coûts.
  • La disponibilité d'un génome assemblé et, en grande mesure étroitement relié à une espèce : le chat domestique.
  • La disponibilité de nouvelles infrastructures de haute capacité pour le séquençage du génome en Espagne.
  • L'expérience et la connaissance accumulée dans le séquençage du génome et dans son analyse, en plus des échantillons biologiques.
Langues disponibles: Anglais Espagnol
Lynxexitu
 
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